Doch woran das liegt ist PU einigermaßen bekannt, also bezüglich der Geschwindigkeit auf manchen der Ports. Bei allen Modellen mit 4 TB3 Ports reichen schlicht die PCI-E Lanes nicht aus um die volle Bandbreite bereitzustellen, da auch die Iris Pro/AMD Polaris GPU sowie die SSD Lanes brauchen und im Macbook keine PLX Switches o.ä. verbaut werden. Ein TB3 mit vollem Funktionsumfang beansprucht 4 PCI-E Lanes: 4*4=16 -> Skylake hat nur 16 Lanes. Dementsprechend hat Apple sich wohl dazu entschieden die volle Funktionalität nur auf 2 der 4 Ports zu bieten.
(Hatte gestern ein Gespräch zu genau dem Thema in einem Apple Store)