Sorry für die späte Antwort.
Okay dann hast Du ja den Übeltäter gefunden. Entweder kann der Crimson sich oder etwas (Update?) nicht installieren oder er schafft es aber es bleiben Reste zurück.
Bzgl. HDD - SSD:
Also nur das Windows kannst Du so nicht so einfach überspielen/neu installieren sodass die Programme auf der HDD bleiben denn im Windows sind die Programme ja mit C: registriert und installiert worden.
Eine Möglichkeit wäre einfach die HDD auf die leere SSD zu klonen. Vorausgesetzt es geht sich vom Platz her aus. Es macht jedoch Sinn die Programme auch auf der SSD zu haben damit diese schneller starten. Deine Daten (Bilder, Videos, Musik, Dokumente etc.), falls diese viel Platz ausmachen, kannst Du ja vorher extern sichern und von der HDD löschen und dann diese Klonen. Wenn das geklappt hat kannst Du die HDD löschen und die Daten dort zurück spielen. Die Bibliotheken vom Windows wie eben Dokumente, Bilder, Videos kannst Du dann einfach auf D: (oder was die geleerte HDD dann ist) zeigen lassen.
Klonprogramme gibt es jede Menge, Freeware fällt mir da auf die Schnelle z.B. Clonezilla ein. Da erstellt man eine Boot CD (oder USB Stick) auf Linux Basis. Macrium Reflect fällt mir auch noch ein ...