Am Besten ist, Du ziehst die HDD vor der Installation von Windows ab, dann kann es Dir auch nicht passieren, dass die versteckte 100MB Bootpartition auf der HDD landet. Stelle den SATA Controller vorher auch noch auf den AHCI Modus, installiere Windows, steck die HDD wieder an, öffne den Laufwerksverwaltung, partitioniere, formatiere sie und weise der Partition einen LW-Buchstaben zu und gut ist, es besteht danach kein Handlungs- oder Optimierungsbedarf! Eigentlich kann man danach nur noch was Verschlimmbessern!