Normalerweise muß man das in den Settings des jeweiligen Programms abschalten. Ich hatte das genannte Problem z.B. beim Programm ArcSoft TotalMedia Theatre 5 und habe daraufhin einfach den Haken "Aero ausschalten beim abspielen von DVD und BluRays" in den ArcSoft Setting entfernt.
Ich denke nicht daß man es generisch für alle Programme abschalten kann.