Der größte Nachteil neben der wirklich indiskutablen Performance (sowohl in Bezug auf das Webinterface als auch die Geschwindigkeit von iDisk oder e-mail Downloads allgemein) ist wohl der immer aktive nicht abschaltbare Mail Filter.
Bitte nicht falsch verstehen, man kann den Spam-Filter deaktivieren. Das funktioniert ganz einfach unter dem entsprechenden Punkt im Menü "Einstellungen". Einen vorgeschalteten weiteren Filter kann man aber nicht beeinflussen. Daher sind mir schon diverse wichtige Mails nicht zugestellt worden, teilweise haben auch einige den Empfänger nicht erreicht. Man kann sich also mit einem MobileMe Konto ausdrücklich niemals sicher sein, was alles aussortiert oder geblockt wird, da es keine Möglichkeit gibt es nachzuvollziehen oder zu beeinflussen.
Wer es nicht glaubt kann sich bspw. einfach mal testweise bei Forumla.de anmelden. Ich wette darum, dass die Bestätigungsmail weder im Spam-Filter noch sonst irgendwo bei euch eintreffen wird. Das Gleiche passiert z.B. auch mit Nachrichten, in denen bestimmte Schlüsselwörter enthalten sind.
Ein weiteres von Apple allerdings nicht zu verantwortendes Manko ist die Tatsache, dass Anbieter wie GMX, WEB.de oder hotmail Nachrichten von MobileMe Accounts sehr häufig von sich aus als Spam klassifizieren.