Welche aktuelle Distributoin kommt denn bitte nicht mit NTFS zurecht? Wir sind nicht mehr im Jahr 2005...
FAT32 empfieht sich eigentlich wirklich nur dann, wenn's gar nicht anders geht. Wenn der TE aber schon bei sowas fragt gehe ich mal nicht davon aus, dass er einen DragonflyBSD Cluster daheim stehen hat, daher NTFS.