Die Eintragung in der Registry sagt nur, wann der Treiber gestartet werden soll und um booten zu können, muss ein passender Treiber für die Systemplatte eben zum Bootzeitpunkt (Wert 0 in der Registry) gestartet werden, für alle anderen Laufwerke reicht es, wenn er bei Bedarf (Wert 3) gestartet wird. Du kannst also sowohl einen IDE wie einen AHCI Treiber mit dem Wert Start = 0 haben, dann kannst Du sowohl im IDE wie im AHCI Modus booten. Den Modus in dem der SATA Host Controller arbeitet wählst Du sowieso immer im BIOS aus, darauf haben die Registryeinstellungen keinen Einfluss.
Achte aber im BIOS darauf, welchen Controller Du umstellst, denn viele Boards haben mehr als einen und dann sollte man eben im Zweifel alle umstellen bzw. den, am dem die SSD auch wirklich hängt. Ein Blicks ins Boardhandbuch kann da sehr hilfreich sein, ebenso wie eine Verfolgung der SATA Kabel bei der genauen Bestimmung des Ports, an dem die SSD wirklich hängt.
Neuinstallieren um den Modus umzustellen ist auch völlig überflüssig.