Die Hardware der NAS-Geräte ist allgemein recht langsam, wobei das DS-106 schon zu den schnellen gehört. Warum der Unterschied zwischen Lesen und Schreiben so groß ist, dürfte nur der Hersteller beantworten können.
eSATA ist da schon die beste Lösung, da du die Geschwindigkeit der Festplatte auch voll nutzen kannst. Ansonsten einen älteren PC (P3 oder sowas) zum Server machen, das wird dann schneller.