Der Kühler ist doch dicht, da läuft nix aus, wenn Du den von der CPU nimmst.
Theoretisch kann das schon so gehen, wenn altes/neues Board denselben CPU-Sockel haben und die Halterung vom Kühler also passt.
Ansonsten: Wasser raus, alles auseinanderbauen, zusammenbauen, Wasser wieder rein. Wenn...