Hm, ich dachte, der 2. PCIe Slot wäre auch ein 16x Slot. Wenn im 1. Slot keine Graka ist, kann ich dann im BIOS einstellen, das der 2. Slot 16x läuft, oder geht das nicht.
Sonst bleibt dann wohl wirklich nur, einen anderen Lüfter einzubauen, damit die Karte in den oberen Slot passt.