Da wird dann wohl irgendwas auf die Festplatten schreiben. Vielleicht das Log, Stichwort ".system" das geschrieben wird? Liegt halt am neuen Samba4.
Wenn du eine einfache Lösung haben willst, wechsle wieder zu Solaris+nappit, unter FreeNAS geht das mittlerweile nicht mehr "so einfach", zu mindestens nicht für den unbedarften Nutzer wie dich der vor dem Posten das Problem nicht einfach mal im offizielen FreeNAS Forum nachschlägt wo es schon etliche Male besprochen worden ist.