Charles hat seinen Geist vor dem Tod in einen anderen Körper transferiert. (Szene nach dem Abspann [Cassandra Nova])
Alle Mutanten haben mit 'geringen' Kräften angefangen und diese wurden stärker. Denk er hat in den Jahren einfach wieder Fortschritt gemacht (wie einen Muskel, den man trainiert).
Wann wurde ihm das gesamte Adamantium entzogen? Im wurden nur die Klauen abgehackt und da dürfte Magneto sich drum gekümmert haben.
In Wolverine - Wege des Kriegers saugt der Silver Samurai das Adamantium aus ihm heraus