Bei der weißen Farbvariante des Deep Silence 4 ist auch der Innenraum weiß lackiert und kontrastiert mit einigen schwarzen Bauteilen. Was den Aufbau angeht, ist der Laufwerksschacht mit zwei modularen HDD/SSD-Käfigen besonders bemerkenswert.
Das Netzteil wird auf Moosgummipuffern weich gelagert und anschließend rückseitig verschraubt. Auch für die Erweiterungskarten wird auf eine Schraubmontage zurückgegriffen. Weil an dieser Stelle Rändelschrauben eingesetzt werden, kann der Schraubenzieher eine kurze Pause einlegen.
Nanoxia hat nicht nur die Fronttür, sondern auch die beiden Seitenteile und den Deckel mit Dämmmaterial verkleidet. Das Dämmmaterial ist unterschiedlich beschaffen. Während die Dämmmatten an den Seitenteilen relativ dünn sind, fallen die Dämmmatten im Deckel dicker aus.