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Um den Zustand des EX2100 überprüfen zu können, sind unter Einstellungen->Hilfsprogramme einige Diagnose-Optionen integriert. Neben einer schnellen oder vollständigen Datenträgerprüfung kann das System auch als Ganzes geprüft werden. Dort befindet sich ebenfalls das ISO-Mounting zur Einbindung von Images. Die Prüfroutinen der Systemprüfung beziehen sich jedoch nur auf sehr rudimentäre Checks wie Systemuhr, Laufwerke, Speicher, Temperatur und Lüfter. Hier werden ausschließlich "Häkchen" angezeigt, nicht aber konkrete Ergebnisse. Hier ist die erweiterte Protokollierung von Systemereignissen etwas hilfreicher.
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Zur Erstellung von Backups bietet sich das My Cloud EX2100 über die bekannte SmartWare-Software als Ziel an, sodass die jeweiligen Client-PCs einfach gesichert werden können. Western Digital bietet dem Käufer hier eine Lizenz für bis zu zehn Arbeitsplätze. Zur Sicherung der Daten, die sich bereits auf dem EX2100 befinden, kann wahlweise eine extern angeschlossene USB-Festplatte, ein anderes WD-NAS, die Cloud oder interne Volumes herhalten. Als Ziel für Apples Time Maschine kann der Bolide ebenfalls eingesetzt werden. Bei internen Sicherungen (bspw. von einem RAID0-Volume auf ein RAID1 oder JBOD) können Ordner angegeben werden, die dann optional nach Zeitplan gesichert werden. Der Benutzer ist jedoch selbst dafür verantwortlich, dass die Ordner auch auf verschiedenen Volumes mit physisch getrennten HDDs liegen.
Unter „Apps“ versteht Western Digital die Bereitstellung von http/ftp und P2P-Downloadern und einem gesonderten Webdateibetrachter. Letzterer ist eine Visualisierung der EX2100-Freigaben/Ordnerstrukturen, wobei man ohne Umwege Dateien löschen, verschieben und kopieren kann. Die erwähnten Downloader hingegen nehmen URLs entgegen, die sie über eine zeitgesteuerte Warteschlange herunterladen. Bei FTP lässt sich ein optionales Anmeldekonto sowie Codepage einstellen. Unter P2P verbirgt sich indes ein Bittorrent-Client, der sich auch mit URLs füttern lässt. Hier sind weitere Parameter hinsichtlich Betriebszeit, Up/Download-Datenraten und Seeding-Zeiten konfigurierbar.