Der erste große Fehler ist es, Commander und PlaywithSix zusammen zu verwenden.
Der DayZ Commander installiert die Mods nämlich in das Installationsverzeichniss von Arma.
PlaywithSix hingegen schiebt die Mods in das Arma Verzeichnis welches im Benutzerordner liegt.
Sollte jetzt eines der beiden Programme, vornehmlich PwS, etwas verbocken oder einer neuere/ältere Version laden kommt es zu o.g. Fehlern.
Ich würde PwS deinstallieren, dann die Mods welche im Arma 2 Verzeichniss im Benutzerordner liegen löschen.
Danach dann nochmal alles auf Anfang. Sollten dann weiterhin Probleme bestehen, kann ich gerne ein wenig Hilfestellung geben.