Kommt halt drauf an, wie man sich das Jahr über verhält. Bei meiner Frau und mir ist es so: ich verdiene erheblich mehr als sie und wir haben trotzdem eine Rückzahlung von 1300€ ans FA. Das Geld muss man sich das Jahr über natürlich bei seite legen, dann ist das eine nette Sache mit 3/5. Wer davon überrumpelt wird, wird dann natürlich erstmal blöd aus der Wäsche schauen.
Die Lohnsteuer ist eben eine Art Vorauszahlung auf die Einkommenssteuer. Bei 3/5 zahlt eben derjenige mit 3 weniger voraus. Bei 4/4 zahlen beiden recht viel voraus was eine Nachzahlung ziemlich selten macht.
Überspitzt gesagt erhält man wenn man nicht extrem viele Werbungskosten hat mit Steuerklasse 3 das Jahr über ein zinsloses Darlehen vom Staat. Die Einkommenssteuer ist ja stets die selbe und vom ZVE abhängig.