smartctl -t long /dev/sdX (smartmontools)
bonnie++ -d /mountverzeichnis/ -r 8G -x 1 -s XXXG -u root -g wheel
8G = RAM Größe, XXXG = HDD Größe in GiB - 1
root und wheel z.B. unter FreeBSD
iozone -R -l 2 -u 4 -r 4k -s 1G -F /mountpoint/F1 /mountpoint/F2 /mountpoint/F3 /mountpoint/F4
man iozone - hab das selbst zusammengebastelt.
dban (sf.net) HDD whipe tool, ein paar mal alle Sektoren überschreiben lassen.
Insgesamte Testprozedur für alle HDDs ~48h unter Last. Wobei du bei den Reds und anderen HDDs da eigentlich schon die Herstellergarantie verlieren würdest...

HDDs fallen meistens in den ersten paar Monaten aus, falls sie diese überleben laufen sie in der Regel 3-5 Jahre ohne nennenswerte Probleme.